セミナー

演　者：高橋　敬二（Applied Biosystems Japan）
日　時：平成２０年６月１０日（火）１５：００〜１７：００
場　所：基礎研究棟２階　教職員ロビー

講演概要

SOLiD^TM シーケンシングケミストリーと特徴
　　フラグメントライブラリ・メィトペアライブラリの調整
　　ライゲースおよび２塩基同時解読法による高精度なシーケンシング
　　さらなるハイスループットへの拡張性

SOLiD^TM を使用したアプリケーションおよびデータ実例
　　ゲノム構造変化の解明
　　SNPの網羅的同定
　　ヌクレオソーム構造の解析

要旨

　今秋発売予定のアプライドバイオシステムズ社製SOLiD^TMはフラグメントライブラリおよびメィトペアライブラリ両者を解析可能な画期的な次世代シーケンサーです。エマルジョンPCRや解析用ビーズの高密度配置といった革新的な技術により、一回のランで最長35bpの配列が数千万本、最大6ギガ（60億）bp弱のマッピング可能（参照配列に対してアライメント可能）な配列データを得ることができ、次世代シーケンサーの中で最高のスループットを実現しています。また、ライゲーション反応によるシーケンシングや2塩基同時解読法の採用により、高い精度が示されています。本セミナーではSOLiD^TMのシーケンシングケミストリーおよび特徴について紹介させていただきます。さらに、SOLiD^TMを用いた共同研究の結果から、興味深い知見が得られつつあります。 ゲノム上の挿入・欠失の同定にSOLiD^TMのメィトペアライブラリの力が示されました。さらに、SNPの網羅的な同定や、ヌクレオソーム構造の解析、トランスクリプトーム解析といった種々のアプリケーションから得られた最新のデータについても併せてご紹介させていただきます。